Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD1Q96CP7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms