Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYTL4Q96C24 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYTL4Q96C24 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYTL4Q96C24 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms