Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DHX58Q96C10 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DHX58Q96C10 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX58Q96C10 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms