Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC8Q96B26 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EXOSC8Q96B26 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms