Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EME1Q96AY2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EME1Q96AY2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EME1Q96AY2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EME1Q96AY2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EME1Q96AY2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EME1Q96AY2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EME1Q96AY2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EME1Q96AY2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EME1Q96AY2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EME1Q96AY2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EME1Q96AY2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EME1Q96AY2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EME1Q96AY2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EME1Q96AY2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EME1Q96AY2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EME1Q96AY2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EME1Q96AY2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EME1Q96AY2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EME1Q96AY2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EME1Q96AY2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EME1Q96AY2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EME1Q96AY2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EME1Q96AY2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EME1Q96AY2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EME1Q96AY2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EME1Q96AY2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EME1Q96AY2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EME1Q96AY2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME1Q96AY2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME1Q96AY2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME1Q96AY2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EME1Q96AY2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EME1Q96AY2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EME1Q96AY2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EME1Q96AY2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EME1Q96AY2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EME1Q96AY2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME1Q96AY2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME1Q96AY2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EME1Q96AY2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms