Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FUBP1Q96AE4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FUBP1Q96AE4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms