Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NEIL2Q969S2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEIL2Q969S2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms