Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSLPQ969D9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSLPQ969D9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSLPQ969D9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSLPQ969D9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSLPQ969D9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TSLPQ969D9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSLPQ969D9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSLPQ969D9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSLPQ969D9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSLPQ969D9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms