Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHMTQ93088 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHMTQ93088 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHMTQ93088 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms