Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP13Q92995 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP13Q92995 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP13Q92995 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP13Q92995 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP13Q92995 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP13Q92995 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP13Q92995 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP13Q92995 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP13Q92995 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP13Q92995 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP13Q92995 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP13Q92995 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP13Q92995 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP13Q92995 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP13Q92995 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP13Q92995 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP13Q92995 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP13Q92995 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP13Q92995 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP13Q92995 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP13Q92995 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP13Q92995 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP13Q92995 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP13Q92995 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP13Q92995 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP13Q92995 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP13Q92995 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP13Q92995 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP13Q92995 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP13Q92995 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP13Q92995 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP13Q92995 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP13Q92995 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP13Q92995 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP13Q92995 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP13Q92995 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP13Q92995 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP13Q92995 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP13Q92995 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms