Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAD50Q92878 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAD50Q92878 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms