Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDEM1Q92611 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDEM1Q92611 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms