Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBXN4Q92575 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBXN4Q92575 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBXN4Q92575 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms