Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS9Q8WXC6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms