Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TWIST2Q8WVJ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TWIST2Q8WVJ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWIST2Q8WVJ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms