Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC7Q8WUI4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC7Q8WUI4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms