Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC44.36■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC44.35■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
RB1CC1Q8TDY2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC44.3■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
RB1CC1Q8TDY2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC44.24■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
RB1CC1Q8TDY2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms