Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ1

CD300LF, CMRF35-like molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LFQ8TDQ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300LFQ8TDQ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300LFQ8TDQ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms