Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PATJQ8NI35 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATJQ8NI35 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms