Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP61Q8NHU2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP61Q8NHU2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms