Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTLL11Q8NHH1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTLL11Q8NHH1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms