Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RDM1Q8NG50 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RDM1Q8NG50 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDM1Q8NG50 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDM1Q8NG50 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDM1Q8NG50 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDM1Q8NG50 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDM1Q8NG50 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDM1Q8NG50 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDM1Q8NG50 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms