Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC148Q8NFR7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC148Q8NFR7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms