Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF548Q8NEK5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF548Q8NEK5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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