Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3C3Q8NEB9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3C3Q8NEB9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms