Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC44A5Q8NCS7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC44A5Q8NCS7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC44A5Q8NCS7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms