Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC5Q8NAU1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC5Q8NAU1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNDC5Q8NAU1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNDC5Q8NAU1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNDC5Q8NAU1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms