Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD42Q8N9B4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD42Q8N9B4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ANKRD42Q8N9B4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms