Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHCHD4Q8N4Q1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD4Q8N4Q1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHCHD4Q8N4Q1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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