Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDR16C5Q8N3Y7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR16C5Q8N3Y7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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