Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHTF2Q8N3S3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHTF2Q8N3S3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 618.2 ms