Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLASRPQ8N2M8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLASRPQ8N2M8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLASRPQ8N2M8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms