Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms