Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC117Q8IWD4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC117Q8IWD4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms