Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERC6Q8IVU3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HERC6Q8IVU3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms