Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KSR1Q8IVT5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms