Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC22A9Q8IVM8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A9Q8IVM8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms