Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PLD3Q8IV08 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLD3Q8IV08 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms