Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACUL1Q86Y37 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACUL1Q86Y37 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACUL1Q86Y37 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms