Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms