Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC51AQ86UW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC51AQ86UW1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC51AQ86UW1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms