Protein–RNA interactions for Protein: Q86SG6

NEK8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, humanhuman

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Length 692 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK8Q86SG6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK8Q86SG6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK8Q86SG6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK8Q86SG6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK8Q86SG6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK8Q86SG6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK8Q86SG6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK8Q86SG6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NEK8Q86SG6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK8Q86SG6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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