Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YTHDF3Q7Z739 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
YTHDF3Q7Z739 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms