Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO2Q7Z6W1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO2Q7Z6W1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO2Q7Z6W1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms