Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
KRT27Q7Z3Y8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT27Q7Z3Y8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT27Q7Z3Y8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms