Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATG9AQ7Z3C6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG9AQ7Z3C6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG9AQ7Z3C6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms