Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSX9Q7RTT3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms