Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUFY3Q7L099 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms