Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYDE1Q6ZW31 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYDE1Q6ZW31 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms