Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM47EQ6ZV65 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM47EQ6ZV65 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms